Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRSK2Q8IWQ3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms