Protein–RNA interactions for Protein: Q86X19

TMEM17, Transmembrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM17Q86X19 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM17Q86X19 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM17Q86X19 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM17Q86X19 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM17Q86X19 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM17Q86X19 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM17Q86X19 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM17Q86X19 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM17Q86X19 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM17Q86X19 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM17Q86X19 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM17Q86X19 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM17Q86X19 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM17Q86X19 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM17Q86X19 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM17Q86X19 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM17Q86X19 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM17Q86X19 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms