Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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