Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms