Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPM2Q86SE8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms