Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms