Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms