Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMUB2Q71RG4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms