Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM5Q71RC9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms