Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
XIRP1Q702N8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
XIRP1Q702N8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
XIRP1Q702N8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
XIRP1Q702N8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
XIRP1Q702N8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
XIRP1Q702N8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
XIRP1Q702N8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
XIRP1Q702N8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
XIRP1Q702N8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
XIRP1Q702N8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
XIRP1Q702N8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
XIRP1Q702N8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
XIRP1Q702N8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
XIRP1Q702N8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
XIRP1Q702N8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
XIRP1Q702N8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
XIRP1Q702N8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
XIRP1Q702N8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
XIRP1Q702N8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
XIRP1Q702N8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
XIRP1Q702N8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms