Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS12Q6ZW61 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms