Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms