Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT07

TBC1D9, TBC1 domain family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9Q6ZT07 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBC1D9Q6ZT07 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TBC1D9Q6ZT07 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms