Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms