Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms