Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM72Q6ZMU5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms