Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms