Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD54Q6NXT1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms