Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SCARA3Q6AZY7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms