Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CARMIL1Q5VZK9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms