Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SFMBT2Q5VUG0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms