Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms