Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LGSNQ5TDP6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LGSNQ5TDP6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LGSNQ5TDP6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms