Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDLRAD1Q5T700 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms