Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BEND3Q5T5X7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BEND3Q5T5X7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
BEND3Q5T5X7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BEND3Q5T5X7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BEND3Q5T5X7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
BEND3Q5T5X7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BEND3Q5T5X7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BEND3Q5T5X7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BEND3Q5T5X7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
BEND3Q5T5X7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BEND3Q5T5X7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BEND3Q5T5X7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BEND3Q5T5X7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BEND3Q5T5X7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BEND3Q5T5X7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BEND3Q5T5X7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BEND3Q5T5X7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
BEND3Q5T5X7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BEND3Q5T5X7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BEND3Q5T5X7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BEND3Q5T5X7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BEND3Q5T5X7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms