Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms