Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
CEP170Q5SW79 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CEP170Q5SW79 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CEP170Q5SW79 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CEP170Q5SW79 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CEP170Q5SW79 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CEP170Q5SW79 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CEP170Q5SW79 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CEP170Q5SW79 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CEP170Q5SW79 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms