Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF6Q58WW2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF6Q58WW2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms