Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms