Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms