Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms