Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF394Q53GI3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms