Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms