Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV1

NBPF20, Neuroblastoma breakpoint family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF20Q3BBV1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBPF20Q3BBV1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF20Q3BBV1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms