Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms