Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ISXQ2M1V0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ISXQ2M1V0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ISXQ2M1V0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ISXQ2M1V0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ISXQ2M1V0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ISXQ2M1V0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ISXQ2M1V0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ISXQ2M1V0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ISXQ2M1V0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ISXQ2M1V0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms