Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFX7Q2KHR2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFX7Q2KHR2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX7Q2KHR2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms