Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
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