Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms