Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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NDUFA9Q16795 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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NDUFA9Q16795 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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NDUFA9Q16795 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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NDUFA9Q16795 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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NDUFA9Q16795 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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NDUFA9Q16795 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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NDUFA9Q16795 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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NDUFA9Q16795 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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