Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NFIL3Q16649 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFIL3Q16649 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIL3Q16649 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIL3Q16649 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIL3Q16649 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIL3Q16649 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIL3Q16649 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIL3Q16649 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIL3Q16649 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIL3Q16649 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIL3Q16649 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIL3Q16649 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIL3Q16649 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIL3Q16649 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIL3Q16649 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIL3Q16649 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIL3Q16649 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFIL3Q16649 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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NFIL3Q16649 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NFIL3Q16649 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NFIL3Q16649 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NFIL3Q16649 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
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NFIL3Q16649 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
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NFIL3Q16649 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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NFIL3Q16649 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
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NFIL3Q16649 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
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