Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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