Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRADDQ15628 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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