Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
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UBE3CQ15386 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3CQ15386 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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