Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NECTIN1Q15223 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
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