Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
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