Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

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Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSME4Q14997 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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