Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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NR1I3Q14994 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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NR1I3Q14994 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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NR1I3Q14994 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
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