Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPNMBQ14956 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPNMBQ14956 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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