Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPIDRQ14159 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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SPIDRQ14159 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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SPIDRQ14159 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
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SPIDRQ14159 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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SPIDRQ14159 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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SPIDRQ14159 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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